64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2185 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 
279 aa  563  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.49 
 
 
410 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.91 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.33 
 
 
432 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.08 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.97 
 
 
415 aa  82  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.67 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.83 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.55 
 
 
579 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.48 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  34.39 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.06 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.06 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  34.19 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.12 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.62 
 
 
722 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  30.46 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.23 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  35.76 
 
 
669 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  32.03 
 
 
669 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.05 
 
 
558 aa  62.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.19 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.47 
 
 
495 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.61 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.08 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  31.65 
 
 
442 aa  60.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.33 
 
 
484 aa  59.7  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  27.12 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.33 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.67 
 
 
246 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  27.89 
 
 
243 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  27.5 
 
 
267 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.13 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  27.81 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.32 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.41 
 
 
196 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.97 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1899  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  36.11 
 
 
289 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0495  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.88 
 
 
332 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  48.28 
 
 
516 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.1 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.59 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.52 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3025  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.06 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000023903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  31.94 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.89 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  37.5 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  29.27 
 
 
236 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  37.5 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  28.17 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  27.19 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.67 
 
 
264 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.89 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  36.11 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  36.11 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  29.82 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  29.06 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.47 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>