92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.54 
 
 		 232 aa  216  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.44 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.8 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.75 
 
 		 484 aa  90.5  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.7 
 
 		 579 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.44 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.3 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.26 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.26 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.07 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 669 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.84 
 
 		 722 aa  68.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.59 
 
 		 432 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.78 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.1 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.23 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  33.85 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.51 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  30.39 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.39 
 
 		 358 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  38.3 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.63 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.59 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  35.82 
 
 		 669 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.8 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  33.33 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.13 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.14 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.37 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  31.76 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  29.37 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09648  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.08 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.538817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  32.82 
 
 		 461 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.71 
 
 		 495 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6027  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.73 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.350512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.78 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04455  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  34.62 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.97 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.51 
 
 		 368 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.29 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  29.45 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  31.58 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  28.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  31.97 
 
 		 267 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.45 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5359  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.69 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.2 
 
 		 259 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.4 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  24.29 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.95 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1102  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.79 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.95 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.4 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.4 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.4 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.4 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.58 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.4 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.4 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  30.53 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0495  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.21 
 
 		 332 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  31.91 
 
 		 442 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.27 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.27 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.52 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.64 
 
 		 275 aa  45.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1861  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.75 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  24.39 
 
 		 246 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2250  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  23.65 
 
 		 303 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0294681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.45 
 
 		 246 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.45 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.8 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.8 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.8 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  23.04 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4758  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.95 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.56 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.51 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.8 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  26.99 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  23.45 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  22.93 
 
 		 246 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4581  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.25 
 
 		 286 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.49 
 
 		 246 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2970  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  31.78 
 
 		 272 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1557  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.32 
 
 		 246 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>