55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5359 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5359  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 
175 aa  360  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6027  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  69.87 
 
 
191 aa  236  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.350512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1418  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  63.16 
 
 
195 aa  213  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1423  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  59.71 
 
 
237 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2611  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.94 
 
 
211 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.132011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0106  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  51.59 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4520  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  48.63 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0342  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  42.31 
 
 
190 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0352  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  42.31 
 
 
229 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0331  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  42.31 
 
 
206 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429303  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2177  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 
207 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148812  normal  0.0743485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0104  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.95 
 
 
196 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2708  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44 
 
 
179 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.826826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2514  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.72 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26850  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.86 
 
 
228 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.405147  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07970  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  47.47 
 
 
291 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131897  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2545  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.16 
 
 
137 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2293  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.5 
 
 
303 aa  87.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2154  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.61 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119345  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.95 
 
 
448 aa  58.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  30.7 
 
 
262 aa  50.8  0.000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  30.23 
 
 
243 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.69 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  26.88 
 
 
237 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  29.23 
 
 
243 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.25 
 
 
275 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  29.25 
 
 
266 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1102  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.91 
 
 
269 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  28.68 
 
 
237 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33 
 
 
246 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.46 
 
 
259 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  28.46 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.59 
 
 
263 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  26.98 
 
 
267 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  25.71 
 
 
250 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  28.91 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32 
 
 
232 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.31 
 
 
259 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.78 
 
 
281 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.83 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.83 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  25.4 
 
 
210 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.83 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.4 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.46 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  26.98 
 
 
248 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.83 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.83 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.83 
 
 
259 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.83 
 
 
259 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1065  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  23.66 
 
 
219 aa  42  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.55 
 
 
257 aa  41.6  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.99 
 
 
245 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.88 
 
 
273 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.83 
 
 
259 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>