44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0106 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0106  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2611  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  59.84 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.132011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1418  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  57.26 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0331  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  53.28 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0342  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  52.46 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0352  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  52.46 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6027  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  54.84 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.350512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26850  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  57.72 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.405147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1423  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  62.16 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5359  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.59 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4520  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  56.56 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2708  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.44 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.826826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0104  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.2 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2177  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  54.1 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148812  normal  0.0743485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2545  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.59 
 
 		 137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2514  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.7 
 
 		 149 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07970  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  50 
 
 		 291 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131897  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2293  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.5 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2154  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.01 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119345  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.48 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  33.71 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.71 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.69 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.69 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1065  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.71 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  26.67 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.92 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.92 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.92 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.92 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.92 
 
 		 259 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.92 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.92 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.15 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.83 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.78 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  29.03 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  29.21 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  30.08 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.59 
 
 		 273 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04455  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  28.26 
 
 		 265 aa  41.6  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25 
 
 		 257 aa  41.6  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>