79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1224 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 
285 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.34 
 
 
558 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.8 
 
 
294 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50 
 
 
447 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.72 
 
 
350 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  45.24 
 
 
348 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.41 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  46.1 
 
 
368 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.61 
 
 
415 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.17 
 
 
449 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.62 
 
 
407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 
722 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.53 
 
 
410 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  45.59 
 
 
669 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.49 
 
 
484 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.85 
 
 
358 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.85 
 
 
392 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.86 
 
 
579 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40 
 
 
404 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.14 
 
 
386 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.13 
 
 
432 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.96 
 
 
495 aa  95.9  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  39.74 
 
 
442 aa  92.4  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
669 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.1 
 
 
396 aa  92  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  41.41 
 
 
461 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.53 
 
 
391 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.55 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  40 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.58 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.85 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.08 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.08 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.59 
 
 
196 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.94 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.67 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.59 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30 
 
 
241 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.25 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.37 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.37 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.37 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.25 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.37 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.37 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.37 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2970  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  30.7 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  28.77 
 
 
248 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.25 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  22.3 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.89 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.63 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.73 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  32.73 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  26.15 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.34 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.09 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.08 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.59 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.59 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.59 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  23.29 
 
 
237 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.59 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.34 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.34 
 
 
246 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.33 
 
 
246 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  25.55 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  24.49 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  26.11 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.17 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  31.13 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.26 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25 
 
 
236 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0259  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.79 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0170483  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4978  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.79 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4603  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.11 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.336858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1813  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  27.07 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.877549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4989  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.11 
 
 
286 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.33 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>