68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3081 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 410 aa  800    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50 
 
 		 407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.54 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.22 
 
 		 722 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.25 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.5 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.15 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.23 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  43.14 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.92 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.35 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.8 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.44 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.29 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  46.03 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  46.09 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.46 
 
 		 495 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.03 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  51.56 
 
 		 669 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  44.59 
 
 		 669 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  46.21 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.67 
 
 		 447 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.25 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  46.88 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.13 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.96 
 
 		 334 aa  106  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  41.54 
 
 		 461 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.21 
 
 		 558 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.88 
 
 		 279 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  35.2 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.96 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.53 
 
 		 245 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.69 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  35.1 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.08 
 
 		 259 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  32.86 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.17 
 
 		 259 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.17 
 
 		 259 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.44 
 
 		 246 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.17 
 
 		 259 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1861  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.55 
 
 		 250 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.82 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  29.29 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  29.17 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2419  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.1 
 
 		 225 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  decreased coverage  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17500  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.050833  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  28.57 
 
 		 210 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2187  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.45 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222762  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.66 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  35.06 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.75 
 
 		 244 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  30.43 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.4 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  29.35 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2914  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.25 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  0.295776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.1 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1764  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  24.24 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.1 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1721  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.25 
 
 		 321 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000495167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.57 
 
 		 284 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  30.43 
 
 		 237 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>