86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  898    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  31.99 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.76 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  36.09 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.86 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.97 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.81 
 
 
396 aa  86.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.06 
 
 
722 aa  86.3  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.13 
 
 
386 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.69 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.82 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.37 
 
 
407 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.95 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.29 
 
 
579 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  26.22 
 
 
564 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.39 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  26.22 
 
 
564 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  29.39 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  32.95 
 
 
669 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  31.05 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  25.84 
 
 
564 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  28.98 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  28.98 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.43 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  30.09 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  25.47 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.59 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.23 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  28.98 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.83 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.14 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  25.47 
 
 
564 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.04 
 
 
447 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 
294 aa  63.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  28.51 
 
 
430 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  27.94 
 
 
578 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.76 
 
 
558 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  27.47 
 
 
577 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.35 
 
 
1284 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  27.27 
 
 
582 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.68 
 
 
580 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.43 
 
 
449 aa  59.7  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  27.68 
 
 
579 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  27.88 
 
 
575 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  26.84 
 
 
598 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.55 
 
 
1776 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  25.52 
 
 
582 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.14 
 
 
350 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.59 
 
 
684 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  37.74 
 
 
348 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
669 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  28.68 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  33.82 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.58 
 
 
368 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  30.61 
 
 
297 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  25.18 
 
 
582 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  26.15 
 
 
459 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.65 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3247  SH3 type 3 domain-containing protein  27.35 
 
 
222 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  29.32 
 
 
478 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  22.08 
 
 
603 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  22.08 
 
 
603 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  28.57 
 
 
420 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  29.08 
 
 
426 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  28.57 
 
 
410 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  28.57 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  28.57 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  26.9 
 
 
310 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  26.9 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  26.9 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  25.34 
 
 
341 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  28.57 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  27.82 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.33 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.3 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  26.52 
 
 
284 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.82 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  26.57 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  26.57 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  26.57 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  26.57 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  26.57 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  28.37 
 
 
410 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  26.76 
 
 
310 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  26.92 
 
 
292 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
382 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>