35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3247 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3247  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.56 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 391 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.54 
 
 		 751 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  28.89 
 
 		 418 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  27.08 
 
 		 564 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.07 
 
 		 377 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  27.08 
 
 		 564 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  27.08 
 
 		 564 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3346  SH3 type 3 domain protein  37.78 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  27.08 
 
 		 564 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  25.68 
 
 		 532 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  27.01 
 
 		 424 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  24.67 
 
 		 532 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  30.83 
 
 		 1067 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  24.63 
 
 		 430 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  24.46 
 
 		 426 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  24.46 
 
 		 420 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  24.46 
 
 		 426 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  31.67 
 
 		 370 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.74 
 
 		 413 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.69 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.41 
 
 		 684 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.74 
 
 		 432 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.39 
 
 		 448 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  33.94 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  23.74 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  23.74 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  23.74 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  23.74 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  40 
 
 		 198 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3335  SH3 type 3 domain-containing protein  40 
 
 		 92 aa  41.6  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.492775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  27.45 
 
 		 577 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  27.45 
 
 		 582 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>