60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1654 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  83.25 
 
 
193 aa  292  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  83.25 
 
 
193 aa  291  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  44.67 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  58.43 
 
 
170 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  52.86 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  34.74 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  30.28 
 
 
589 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  32.95 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  30.28 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  25.99 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  40.68 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  40.68 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  33.63 
 
 
312 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  33.63 
 
 
312 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  35.44 
 
 
287 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  32.91 
 
 
232 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  32.91 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  43.64 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  31.86 
 
 
301 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  33.63 
 
 
275 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  24.62 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  25.38 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  28.81 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  28.95 
 
 
289 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  26.92 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  30.1 
 
 
316 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  42.62 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  32.61 
 
 
283 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  37.68 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  26.61 
 
 
239 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  32.91 
 
 
311 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  29.36 
 
 
259 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
319 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.12 
 
 
553 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  30.77 
 
 
264 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0047  hypothetical protein  30.06 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.71 
 
 
657 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  31.82 
 
 
370 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  38.6 
 
 
582 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  38.6 
 
 
577 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  38.6 
 
 
582 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  38.6 
 
 
582 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  38.6 
 
 
579 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  38.6 
 
 
598 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  38.6 
 
 
341 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 
580 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.48 
 
 
616 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  31.65 
 
 
574 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
578 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  25.2 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
474 aa  42  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  37.04 
 
 
575 aa  41.6  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  32.2 
 
 
564 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  32.2 
 
 
564 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  37.04 
 
 
536 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  32.5 
 
 
235 aa  41.2  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  32.2 
 
 
564 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  32.2 
 
 
564 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
382 aa  41.2  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>