31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4134 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  100 
 
 		 312 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  89.1 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  82.7 
 
 		 289 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  83.96 
 
 		 283 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  87.1 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  78.12 
 
 		 281 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  55.3 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  55.47 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  39.33 
 
 		 259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  57.14 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  42.86 
 
 		 239 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  41.91 
 
 		 224 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  38.52 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  41.67 
 
 		 214 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  41.14 
 
 		 589 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  35.96 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  41.94 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  33.86 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  31.72 
 
 		 165 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.51 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  35.51 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  33.63 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  32.95 
 
 		 2914 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.33 
 
 		 2179 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  35.92 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  30.36 
 
 		 193 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  31.52 
 
 		 193 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  25.17 
 
 		 1888 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  31.82 
 
 		 167 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  30.68 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>