38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4419 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  89.55 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  69.35 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  61.9 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  51.4 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  39.74 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  50.44 
 
 		 184 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  42.22 
 
 		 275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  41.3 
 
 		 281 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  41.91 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  41.91 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  37.78 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  38.52 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  41.61 
 
 		 589 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  38.52 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  41.35 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  41.35 
 
 		 311 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  40.31 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  41.32 
 
 		 316 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  38.61 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  34.82 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.92 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  32.5 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  36.89 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  35.85 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  42.86 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  46.3 
 
 		 100 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  32.86 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  37.14 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  32.86 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  32.86 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 382 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  34.78 
 
 		 1216 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  34.78 
 
 		 1216 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  33.72 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.32 
 
 		 472 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>