27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1900 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  100 
 
 
275 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  71.43 
 
 
301 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  68.59 
 
 
312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  68.59 
 
 
312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  80.33 
 
 
289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  80.21 
 
 
283 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  75.79 
 
 
281 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  50.76 
 
 
259 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  50.76 
 
 
311 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  52.34 
 
 
316 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  42.22 
 
 
224 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  42.11 
 
 
239 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  53.06 
 
 
264 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  40 
 
 
232 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  41.72 
 
 
589 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  36.45 
 
 
214 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  33.07 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  32.65 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  33.6 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  38.95 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  33.63 
 
 
198 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  30.84 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  29.91 
 
 
205 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  30.19 
 
 
193 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  32.61 
 
 
193 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  31.5 
 
 
167 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  32.71 
 
 
170 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>