37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4099 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  89.55 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  64.52 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  60.32 
 
 		 287 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  53.98 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  53.27 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  40.77 
 
 		 165 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  36.05 
 
 		 589 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  40.58 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  40 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  38.52 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  39.26 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  40.44 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  40.44 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  41.35 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  38.64 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  39.26 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  40.15 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  38.33 
 
 		 316 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  42.57 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  43.64 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  36.89 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  46.3 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.92 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  32.5 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  38.46 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  32.1 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  32.86 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  38.57 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  34.88 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 382 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.1 
 
 		 472 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>