77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0736 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  339  9e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  98.97 
 
 
100 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  67.92 
 
 
167 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  44.44 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  44.44 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  52.59 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  36.5 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  32.73 
 
 
589 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  34.06 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  37.07 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  29.05 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  46.05 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  38.14 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  49.21 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  49.21 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  32.08 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  30.16 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  29.34 
 
 
283 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  29.93 
 
 
289 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  46.07 
 
 
225 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  33.02 
 
 
316 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  30.82 
 
 
312 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  30.07 
 
 
259 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  30.82 
 
 
312 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  30.56 
 
 
275 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  29.37 
 
 
281 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  34.23 
 
 
311 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  28.86 
 
 
301 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  38.82 
 
 
210 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  38.83 
 
 
205 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  37.86 
 
 
205 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  26.51 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  36.25 
 
 
287 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.35 
 
 
580 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  32.71 
 
 
264 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  42.11 
 
 
341 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  40.35 
 
 
598 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  40.35 
 
 
582 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  40.35 
 
 
579 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5056  SH3 type 3 domain protein  42.86 
 
 
94 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0895479  normal  0.96171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5003  SH3 type 3 domain protein  42.11 
 
 
94 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4543  SH3 type 3 domain-containing protein  42.11 
 
 
94 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.146973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
578 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  40.35 
 
 
582 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  40.35 
 
 
577 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  40.35 
 
 
582 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
575 aa  44.3  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4859  SH3 type 3 domain-containing protein  40.35 
 
 
93 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1863  SH3 type 3 domain-containing protein  30.34 
 
 
93 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.555002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  32.14 
 
 
319 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  32.14 
 
 
564 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  32.14 
 
 
564 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  39.06 
 
 
422 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  39.06 
 
 
469 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.9 
 
 
476 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.86 
 
 
474 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  32.14 
 
 
564 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  34.43 
 
 
574 aa  42  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.92 
 
 
472 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  32.43 
 
 
292 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0047  hypothetical protein  42 
 
 
195 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.92 
 
 
907 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  33.73 
 
 
370 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  32.79 
 
 
564 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  37.5 
 
 
414 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  37.5 
 
 
386 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.07 
 
 
553 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  37.5 
 
 
386 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  46.34 
 
 
358 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  37.5 
 
 
420 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  27.06 
 
 
420 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  37.5 
 
 
410 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.06 
 
 
420 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  37.5 
 
 
478 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  27.06 
 
 
420 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  37.5 
 
 
410 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  37.5 
 
 
426 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>