54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3015 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  95.61 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  60.54 
 
 		 210 aa  230  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  43.52 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  33.85 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  32.81 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  39.08 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  35.45 
 
 		 589 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  38.05 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  32.05 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  39.81 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  35.51 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  35.51 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  35.44 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  35.24 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  35.24 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  34.62 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  32.71 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  33.65 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  35.64 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  33.98 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  44.12 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  33.01 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  32.04 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  36.96 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  30.61 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  25.38 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  43.08 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  33.63 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 131 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  36.84 
 
 		 95 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  41.03 
 
 		 104 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  38.46 
 
 		 104 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  38.27 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  41.43 
 
 		 131 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  32.1 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4403  SH3 type 3 domain-containing protein  37.31 
 
 		 353 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  43.28 
 
 		 137 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  42.65 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  43.48 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1695  hypothetical protein  38.71 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.782082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  39.51 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  34 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  43.94 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  41.79 
 
 		 129 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  38.16 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  35.71 
 
 		 132 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0328  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.213392  normal  0.64697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  38.81 
 
 		 139 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>