35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1280 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  270  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  79.14 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  77.7 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  74.59 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  73.77 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  73.77 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  58.4 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  57.6 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  72.8 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  59.84 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  70.73 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  61.87 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  67.63 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  56.12 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  75 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  56.12 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  56.12 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  54.81 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  39.57 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  38.76 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  45 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  44.59 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  43.84 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  42.47 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  37.76 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  38.24 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  38.55 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  38.55 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  40.14 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  36.84 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  29.06 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  31.3 
 
 		 276 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  35.8 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>