20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4588 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  70.06 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  56.55 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  63.41 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  67.78 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  67.78 
 
 		 190 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  33.03 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  32.5 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  28.79 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  70.97 
 
 		 62 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  25.86 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  40.24 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  39.51 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  45.76 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  31.58 
 
 		 111 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  46.88 
 
 		 704 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  29.08 
 
 		 207 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>