21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4684 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  88.83 
 
 		 190 aa  227  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  59.57 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  61.59 
 
 		 278 aa  147  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  54.27 
 
 		 244 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  50 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  93.55 
 
 		 62 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  37.72 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  32.32 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  38.46 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  43.9 
 
 		 238 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  47.62 
 
 		 292 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  46.34 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  30.53 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  38.55 
 
 		 466 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  31.13 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  35.81 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  37.63 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3867  hypothetical protein  26.06 
 
 		 333 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  31.58 
 
 		 111 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3890  hypothetical protein  23.46 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>