20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0790 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  87.71 
 
 		 292 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  46.18 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  52.48 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  30.26 
 
 		 223 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  28.45 
 
 		 238 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  27.72 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  28.4 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  46.15 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  43.37 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  30.52 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  46.34 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  46.34 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  29.29 
 
 		 466 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  27.14 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  49.18 
 
 		 62 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3890  hypothetical protein  26.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4136  hypothetical protein  26.51 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>