17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0452 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  50.72 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  59.63 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  51.83 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  71.56 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  51.91 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  26.26 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  78.33 
 
 		 62 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  34.41 
 
 		 223 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  35.48 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  35.29 
 
 		 219 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  31.67 
 
 		 238 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  44.71 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  46.15 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  27.27 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  43.1 
 
 		 466 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  36.71 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>