21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0171 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 244 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  70 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  54.14 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  49.48 
 
 		 266 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  48.12 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  45.45 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  39.43 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  26.95 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  35.56 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  73.33 
 
 		 62 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  45.88 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  29.79 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  43.37 
 
 		 294 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  43.21 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  31.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  46.55 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  38.18 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3890  hypothetical protein  32.1 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4136  hypothetical protein  31.71 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>