23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2866 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  53.72 
 
 		 238 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  53.2 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  44.78 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  50.87 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  39.26 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  30.24 
 
 		 294 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  37.59 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  32.62 
 
 		 276 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  35.9 
 
 		 292 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  44.64 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  44.64 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  38.98 
 
 		 278 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  31.96 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  31.43 
 
 		 466 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  36.61 
 
 		 229 aa  84.7  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2865  hypothetical protein  56.04 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  52.46 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  29.61 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5638  protein of unknown function DUF1236  34.15 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  32.53 
 
 		 111 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3720  protein of unknown function DUF1236  31.87 
 
 		 115 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  29.46 
 
 		 148 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>