19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6931 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  89.42 
 
 		 294 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  45.45 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  54.46 
 
 		 229 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  30.57 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  35.9 
 
 		 219 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  30.3 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  30.49 
 
 		 276 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  45.12 
 
 		 223 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  31.85 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  41.67 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  47.44 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  47.62 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  47.62 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  31.71 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  30.8 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  26.67 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  49.21 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3890  hypothetical protein  26.51 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>