19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1397 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 
276 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  46.65 
 
 
292 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  45.28 
 
 
294 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  56.32 
 
 
229 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  31.76 
 
 
238 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  31.98 
 
 
223 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  31.96 
 
 
229 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  42.86 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  40.48 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  30.13 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  27.96 
 
 
207 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  42.11 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  42.11 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  44.16 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  27.07 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  49.15 
 
 
62 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  26.97 
 
 
245 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.72 
 
 
957 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>