21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5226 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 62 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  93.55 
 
 		 190 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  93.55 
 
 		 217 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  70.97 
 
 		 276 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  78.33 
 
 		 278 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  73.33 
 
 		 244 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  72.58 
 
 		 266 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  52.46 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  45.9 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  49.18 
 
 		 238 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  50.85 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  46.67 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  46.67 
 
 		 466 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  49.21 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  49.18 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  49.15 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  40 
 
 		 245 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  34.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  40.98 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5638  protein of unknown function DUF1236  32.2 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3890  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>