19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4730 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  35.37 
 
 		 292 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  55.95 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  31.87 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  29.85 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  31.19 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  35.29 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  32.2 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  31.76 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  31.82 
 
 		 466 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  36.27 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  32.91 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  37.63 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  37.63 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  36.71 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  40.98 
 
 		 62 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  22.89 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2420  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.18 
 
 		 695 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0370858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>