16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1807 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 245 aa  474  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  28.71 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  28.26 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  26.4 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  31.61 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  24.9 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  31.82 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  29.09 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  31.82 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  26.29 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  24.32 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  40 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  23.85 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  22.89 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  26.97 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>