20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2434 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  55.33 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  55.77 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  46.56 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  55.43 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  35.09 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1397  protein of unknown function DUF1236  31.76 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  30.27 
 
 		 292 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  36.91 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  41.46 
 
 		 294 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  30.66 
 
 		 466 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  43.68 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  39.25 
 
 		 190 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4730  hypothetical protein  43.37 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00433602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  49.18 
 
 		 62 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  30.61 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5638  protein of unknown function DUF1236  36.59 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  32.93 
 
 		 111 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>