26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7467 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 111 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5638  protein of unknown function DUF1236  68.29 
 
 		 114 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3720  protein of unknown function DUF1236  40 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  32.17 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  32.17 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  31.07 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  32.53 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  32.93 
 
 		 238 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  31.18 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  35.53 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  29.63 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  34.48 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  31.58 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  28.92 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  33.02 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  31.58 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  32.08 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  30.26 
 
 		 244 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0452  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  37.04 
 
 		 466 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0790  protein of unknown function DUF1236  33.75 
 
 		 294 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  37.04 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  32.14 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>