50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1202 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 104 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  93.27 
 
 		 104 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  51.92 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  54.37 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  56.52 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  56.52 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  46.27 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  53.73 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  45.71 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  48.61 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  45.71 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  49.28 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  43.84 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  46.38 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  46.38 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  38.53 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  44.78 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  49.23 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  44.29 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  43.48 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  47.83 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  45.71 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  42.03 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  38.38 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  44.29 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  46.38 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  42.03 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  32.17 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  36.62 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  37.97 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  31.36 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  39.13 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  38.46 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  43.28 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  36.23 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  38.57 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  37.31 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  40.3 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  41.79 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  40.3 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  37.14 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  40.3 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  37.14 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  37.7 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5638  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>