42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4377 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  63.22 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  55.34 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  54.37 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  55.22 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  50.75 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  49.28 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  46.38 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  49.28 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  49.28 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  47.83 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  43.48 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  38.55 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  47.83 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  46.38 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  35.87 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  43.48 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  41.43 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  43.08 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  40.3 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  37.31 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  39.71 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  37.68 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  39.71 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  38.03 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  38.24 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  38.24 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  38.24 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  36.62 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  35.21 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  34.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  40.98 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  33.82 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  37.7 
 
 		 220 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  28.57 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>