34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1500 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 132 aa  248  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  96.21 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  88.64 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  77.78 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  56.38 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  76.19 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  59.63 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  59.09 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  65.75 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  63.83 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  58.9 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  46.05 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  52.27 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  44.19 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  43.02 
 
 		 221 aa  70.1  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  43.02 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  52.78 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  43.62 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  37.21 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  37.1 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  37.86 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  39.2 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  37.72 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  49.28 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  41.89 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  32.62 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  53.12 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  35.71 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  32.58 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  35.71 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  35.62 
 
 		 466 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  33.77 
 
 		 230 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>