68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3026 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  99.55 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  83.26 
 
 		 220 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  44.85 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  33.51 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  34.55 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  33.64 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  49.11 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  41.94 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  46.58 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  52.73 
 
 		 100 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  43.24 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  52.73 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  42.37 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  42.37 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  32.38 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  47.27 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  46.58 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  42.47 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  36.62 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  34.15 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  44.59 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  39.34 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  32.22 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  32.05 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  44.59 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  38.24 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  35.37 
 
 		 589 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  44.07 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  42.39 
 
 		 131 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  42.47 
 
 		 131 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  33.64 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  30.17 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  40.22 
 
 		 131 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  33.75 
 
 		 122 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  32.08 
 
 		 311 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  31.78 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  34.44 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  33.93 
 
 		 603 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  36.9 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  33.87 
 
 		 95 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  29.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  33.93 
 
 		 603 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  35.19 
 
 		 582 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  35.19 
 
 		 582 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.19 
 
 		 580 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  35.19 
 
 		 579 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  39.44 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  35.19 
 
 		 598 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  35.19 
 
 		 577 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  35.19 
 
 		 582 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  35.19 
 
 		 341 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  40.58 
 
 		 129 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  30.63 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.94 
 
 		 553 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 575 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 578 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  30.51 
 
 		 137 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  30.51 
 
 		 564 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  25.97 
 
 		 319 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  30.51 
 
 		 564 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3335  SH3 type 3 domain-containing protein  32.93 
 
 		 92 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.492775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  30.51 
 
 		 564 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  27.59 
 
 		 564 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  26.72 
 
 		 564 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>