35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0569 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 139 aa  266  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  79.14 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  76.26 
 
 		 138 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  86.33 
 
 		 139 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  69.06 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  51.52 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  49.24 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  48.48 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  56 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  67.47 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  53.28 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  53.28 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  54.4 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  53.28 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  51.8 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  62.82 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  59.04 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  51 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  44.37 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  57.83 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  41.01 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  47.3 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  47.3 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  45.71 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  44.09 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  38.57 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  42.03 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  31.91 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  32.94 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  32.94 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  39.13 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  41.43 
 
 		 94 aa  40  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>