34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0713 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  262  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  84.17 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  86.33 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  74.82 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  68.35 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  53.73 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  52.99 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  53.79 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  56.8 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  56.8 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  55.74 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  55.74 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  55.74 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  66.27 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  52.52 
 
 		 138 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  53 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  51.8 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  62.82 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  43.17 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  56.76 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  45.07 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  59.04 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  54.05 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  45.59 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  45.59 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  41.79 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  37.35 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  54.9 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  54 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  54 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  33.81 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  40.86 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  32.86 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  37.93 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>