35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0136 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  264  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  84.17 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  71.22 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  79.14 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  68.35 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  55.81 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  50.77 
 
 		 137 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  68.67 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  57.6 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  56 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  53.28 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  53.28 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  53.28 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  52.52 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  65.38 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  53 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  59.04 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  48.51 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  45.07 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  57.83 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  52.7 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  47.06 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  47.06 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  44.12 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  45.45 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  44.16 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  43.62 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  41.38 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  51.92 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  51.92 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  53.85 
 
 		 105 aa  43.5  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  32.53 
 
 		 210 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>