33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5270 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  263  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  91.97 
 
 
137 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  74.64 
 
 
137 aa  157  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  73.91 
 
 
137 aa  156  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  73.91 
 
 
137 aa  156  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  46.72 
 
 
137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  52.94 
 
 
137 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  60 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  53.39 
 
 
148 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  58.46 
 
 
138 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  70.49 
 
 
139 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  64.75 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  64.03 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  54.96 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  67.86 
 
 
137 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  56.93 
 
 
137 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  58.62 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  56.03 
 
 
139 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  53.52 
 
 
142 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  40.15 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  38.52 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  45.57 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  43.84 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  33.56 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  34.33 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  33.58 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  40.74 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  40.74 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  34.51 
 
 
276 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  37.04 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  31.03 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  35.29 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  30.43 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>