31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5927 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 137 aa  265  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  91.97 
 
 		 137 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  76.09 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  75.36 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  75.36 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  60.77 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  62.31 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  73.77 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  47.45 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  53.78 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  69.06 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  54.92 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  66.91 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  56.49 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  71.43 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  58.39 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  57.76 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  58.62 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  53.52 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  40.88 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  36.3 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  45.57 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  43.84 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  31.54 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  34.33 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  36.21 
 
 		 276 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  39.76 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  39.76 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  33.62 
 
 		 244 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  37.04 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>