28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4429 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  266  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  89.13 
 
 
138 aa  191  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  72.73 
 
 
137 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  71.9 
 
 
137 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  71.9 
 
 
137 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  79.14 
 
 
139 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  62.4 
 
 
148 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  80.72 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  54.68 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  54.68 
 
 
137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  69.6 
 
 
137 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  66.4 
 
 
137 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  55.4 
 
 
138 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  60.43 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  50.36 
 
 
138 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  55.2 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  56.03 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  56.9 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  49.24 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  42.16 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  35.97 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  41.25 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  39.19 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  38.57 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  37.14 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  38.16 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  38.16 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  36.23 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>