37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0328 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0328  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  361  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.213392  normal  0.64697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1695  hypothetical protein  96.55 
 
 		 193 aa  322  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.782082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2552  SH3 type 3 domain-containing protein  64.67 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2431  SH3, type 3  33.59 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0552  SH3, type 3  40.32 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  34.07 
 
 		 575 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.63 
 
 		 616 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  35.38 
 
 		 418 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  44.7  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.6 
 
 		 420 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  37.1 
 
 		 432 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.6 
 
 		 413 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.6 
 
 		 426 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 430 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 426 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 382 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  30 
 
 		 564 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  40.35 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  30 
 
 		 564 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  30 
 
 		 564 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  31.08 
 
 		 564 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  30 
 
 		 564 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0462  SH3 type 3 domain-containing protein  32.99 
 
 		 1751 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  36.51 
 
 		 582 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  37.93 
 
 		 577 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  29.69 
 
 		 315 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  40 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.51 
 
 		 580 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  36.51 
 
 		 598 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  37.93 
 
 		 582 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  35.82 
 
 		 582 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  36.51 
 
 		 579 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>