18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2431 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2431  SH3, type 3  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0328  SH3 type 3 domain-containing protein  33.59 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.213392  normal  0.64697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1695  hypothetical protein  40.91 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.782082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 575 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  37.65 
 
 		 578 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.84 
 
 		 474 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2552  SH3 type 3 domain-containing protein  33.72 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  38.46 
 
 		 582 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  38.46 
 
 		 579 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  38.46 
 
 		 582 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  38.46 
 
 		 577 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  38.46 
 
 		 598 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.46 
 
 		 580 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  38.46 
 
 		 582 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  37.93 
 
 		 370 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  38.46 
 
 		 341 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 		 553 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  29.03 
 
 		 147 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>