63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2552 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2552  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  340  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1695  hypothetical protein  65.12 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.782082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0328  SH3 type 3 domain-containing protein  64.91 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.213392  normal  0.64697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0552  SH3, type 3  47.46 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.96 
 
 		 377 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  39.39 
 
 		 341 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 578 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  39.34 
 
 		 582 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 575 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  39.34 
 
 		 579 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  39.34 
 
 		 598 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  39.34 
 
 		 582 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.34 
 
 		 580 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  39.34 
 
 		 577 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  39.34 
 
 		 582 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  40.98 
 
 		 625 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  32.04 
 
 		 459 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3346  SH3 type 3 domain protein  40.74 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2431  SH3, type 3  33.72 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3483  SH3 type 3 domain protein  38.89 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 556 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  32.79 
 
 		 292 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 418 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.18 
 
 		 474 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  39.66 
 
 		 280 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 536 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  33.75 
 
 		 430 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 476 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.12 
 
 		 616 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  28.81 
 
 		 370 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 		 420 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 		 420 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  32.1 
 
 		 564 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  36.84 
 
 		 420 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 		 420 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  32.1 
 
 		 564 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  32.1 
 
 		 564 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0496  SH3 type 3 domain protein  29.49 
 
 		 127 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  29.51 
 
 		 321 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.09 
 
 		 432 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.09 
 
 		 413 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 		 426 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 		 420 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  32.2 
 
 		 478 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  37.68 
 
 		 356 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  32.2 
 
 		 564 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  32.2 
 
 		 386 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3407  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.81 
 
 		 351 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000173531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  36.84 
 
 		 426 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  32.2 
 
 		 386 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  32.2 
 
 		 414 aa  41.2  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  33.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  32.2 
 
 		 420 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  32.2 
 
 		 410 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  33.33 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  32.2 
 
 		 469 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  32.2 
 
 		 426 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  32.2 
 
 		 410 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>