264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2948 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 
280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  41.43 
 
 
261 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  39.43 
 
 
258 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  56.13 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  60.16 
 
 
300 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  56.83 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  49.43 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  38.46 
 
 
270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  38.52 
 
 
263 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  38.28 
 
 
275 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  38.28 
 
 
275 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  49.45 
 
 
244 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  37.67 
 
 
270 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  37.93 
 
 
275 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  37.93 
 
 
275 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  37.93 
 
 
275 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  37.93 
 
 
275 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  57.81 
 
 
245 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  47.98 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  56.45 
 
 
129 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  44.06 
 
 
274 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  45.34 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.38 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  45.71 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  45.65 
 
 
203 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  48 
 
 
255 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1623  SCP-like extracellular  46.46 
 
 
259 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.015038  hitchhiker  0.000000394389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  38.33 
 
 
209 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  36.07 
 
 
465 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  43.75 
 
 
373 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.67 
 
 
213 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  43.75 
 
 
344 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  35.68 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  43.75 
 
 
344 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  36.36 
 
 
458 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.02 
 
 
443 aa  96.3  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.29 
 
 
444 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  42.19 
 
 
344 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  43.55 
 
 
353 aa  95.5  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  42.19 
 
 
336 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  42.19 
 
 
344 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  42.19 
 
 
242 aa  95.5  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  42.19 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  42.19 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  42.19 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  42.19 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  47.66 
 
 
450 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  41.78 
 
 
197 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  40.15 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  39.53 
 
 
212 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  40.71 
 
 
495 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  44.34 
 
 
541 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  41.59 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  39.69 
 
 
500 aa  89.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  37.01 
 
 
305 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  37.96 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  42.06 
 
 
341 aa  87  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  36.8 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  36.17 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  39.39 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  35.81 
 
 
196 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  42.2 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  35.65 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  35.81 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  39.82 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  34.78 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  39.82 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  32.76 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  42.06 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  42.06 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  36.8 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  33.59 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  36.15 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2400  SCP-like extracellular  38.46 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00828302  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  32.17 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0369  SCP-like extracellular  36.57 
 
 
570 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.879788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  35.37 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  32.62 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  37.17 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.89 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  34.85 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  35.38 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  38.1 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  36.03 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  29.6 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  33.82 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  35.17 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  32.14 
 
 
335 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  37.4 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.8 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  35.9 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.71 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.58 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  36.63 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  32.68 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2154  SCP-like extracellular  30.77 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0070  SCP-like extracellular  29.33 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  37.23 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>