28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0552 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0552  SH3, type 3  100 
 
 		 206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2552  SH3 type 3 domain-containing protein  47.46 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1695  hypothetical protein  40.24 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.782082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0328  SH3 type 3 domain-containing protein  39.02 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.213392  normal  0.64697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3483  SH3 type 3 domain protein  38.6 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  27.42 
 
 		 564 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 575 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  27.42 
 
 		 564 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  27.42 
 
 		 564 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  26.61 
 
 		 564 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  38.33 
 
 		 625 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.91 
 
 		 553 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3346  SH3 type 3 domain protein  35.09 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  31.43 
 
 		 578 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3762  SH3 type 3 domain-containing protein  28.38 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.193604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  30 
 
 		 582 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4403  SH3 type 3 domain-containing protein  34.88 
 
 		 353 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  30 
 
 		 582 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  24.76 
 
 		 564 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  30 
 
 		 582 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30 
 
 		 577 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.35 
 
 		 471 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  30 
 
 		 598 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 580 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  30 
 
 		 579 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 296 aa  41.6  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  30 
 
 		 341 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3943  SH3 type 3 domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>