11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3346 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3346  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 140 aa  287  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3483  SH3 type 3 domain protein  59.29 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  55.56 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  36.27 
 
 		 1067 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3247  SH3 type 3 domain-containing protein  37.78 
 
 		 222 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2552  SH3 type 3 domain-containing protein  40.74 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  41.67 
 
 		 879 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0552  SH3, type 3  35.09 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  35.53 
 
 		 556 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 		 625 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.87 
 
 		 553 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>