140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_A0006 on replicon NC_008263
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  100 
 
 		 1067 aa  2169    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  57.38 
 
 		 879 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  72.8 
 
 		 356 aa  294  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  46.19 
 
 		 550 aa  205  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  41.45 
 
 		 573 aa  181  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.72 
 
 		 553 aa  96.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  35.37 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 420 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 420 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  30.54 
 
 		 420 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 420 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  37.5 
 
 		 420 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  31.41 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  36.72 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  37.41 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.41 
 
 		 1776 aa  79.3  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  28.92 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  28.92 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  36.72 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  34.69 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.44 
 
 		 1049 aa  78.2  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  32.37 
 
 		 582 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  31.95 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  36.69 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  31.65 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  31.65 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  31.65 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.65 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  31.65 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  31.17 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  35.82 
 
 		 384 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  29.71 
 
 		 582 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  31.68 
 
 		 553 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30.94 
 
 		 577 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 969 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  35.21 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  37.4 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  37.4 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  37.69 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.69 
 
 		 386 aa  72  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  34.81 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  36.57 
 
 		 384 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  33.8 
 
 		 564 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  30.46 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  29.58 
 
 		 578 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  34.04 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  34.04 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  34.04 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  36.64 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.64 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.82 
 
 		 1284 aa  68.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.26 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.45 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.28 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.48 
 
 		 860 aa  58.9  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  32.06 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  31.3 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  31.3 
 
 		 414 aa  57.4  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  31.3 
 
 		 410 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  43.9 
 
 		 546 aa  57  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  31.3 
 
 		 478 aa  56.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.56 
 
 		 889 aa  55.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.84 
 
 		 476 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  26.44 
 
 		 377 aa  55.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  25.18 
 
 		 532 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  28.68 
 
 		 316 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  31.82 
 
 		 420 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  31.82 
 
 		 386 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.2 
 
 		 377 aa  53.9  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  27.48 
 
 		 298 aa  54.3  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.91 
 
 		 311 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  31.82 
 
 		 386 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  28.47 
 
 		 574 aa  54.3  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  31.82 
 
 		 410 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  31.82 
 
 		 426 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  53.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  27.91 
 
 		 310 aa  53.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  53.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  35.64 
 
 		 351 aa  53.5  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.32 
 
 		 262 aa  52.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  27.86 
 
 		 292 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3871  hypothetical protein  51.06 
 
 		 332 aa  53.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.47 
 
 		 448 aa  52  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2130  hypothetical protein  48.94 
 
 		 332 aa  51.2  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0181569  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  25.74 
 
 		 459 aa  51.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  25.6 
 
 		 321 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  24.82 
 
 		 292 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  27.14 
 
 		 338 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 382 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  28.23 
 
 		 524 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  24.64 
 
 		 536 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  28.23 
 
 		 548 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  27.14 
 
 		 290 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>