37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2761 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1103    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  48.57 
 
 
577 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  70.8 
 
 
545 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  41.38 
 
 
454 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  48.48 
 
 
824 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  50.68 
 
 
402 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  50.74 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  52.1 
 
 
201 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  57.85 
 
 
607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  61.29 
 
 
804 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  54.05 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  50 
 
 
234 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  53.61 
 
 
161 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  35.26 
 
 
643 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  37.41 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.6 
 
 
913 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  39.31 
 
 
922 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  40.19 
 
 
1309 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  37.86 
 
 
1219 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  40.91 
 
 
935 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 
1217 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  50 
 
 
1333 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  38.18 
 
 
1137 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  42.27 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  43.9 
 
 
1067 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  28.71 
 
 
723 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3871  hypothetical protein  47.06 
 
 
332 aa  50.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030745  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  33.04 
 
 
224 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2130  hypothetical protein  47.06 
 
 
332 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0181569  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  39.19 
 
 
1086 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  37.66 
 
 
222 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  38.37 
 
 
197 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  33.67 
 
 
1333 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  38.03 
 
 
184 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  39.24 
 
 
3456 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0269  hypothetical protein  25.61 
 
 
454 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0494109  normal  0.0588127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  34.94 
 
 
405 aa  43.9  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>