73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_B0001 on replicon NC_008264
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  100 
 
 		 879 aa  1789    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  57.99 
 
 		 1067 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  44.77 
 
 		 573 aa  188  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  42.49 
 
 		 550 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  49.54 
 
 		 356 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  29.37 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.98 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.67 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.32 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  45.16 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  45.16 
 
 		 549 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  30.3 
 
 		 370 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.98 
 
 		 1049 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  42.65 
 
 		 969 aa  55.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.81 
 
 		 1074 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  46.94 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 365 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  29.22 
 
 		 235 aa  52.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  46.94 
 
 		 383 aa  52  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  26.99 
 
 		 564 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 578 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  44.9 
 
 		 384 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  38.27 
 
 		 582 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  44.9 
 
 		 386 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  27.44 
 
 		 564 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  46.94 
 
 		 386 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.9 
 
 		 386 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.9 
 
 		 386 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  27.44 
 
 		 564 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  44.9 
 
 		 386 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  46.94 
 
 		 384 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  44.9 
 
 		 386 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  27.44 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  44.9 
 
 		 386 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.04 
 
 		 580 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  37.04 
 
 		 579 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  37.04 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  37.04 
 
 		 582 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  25.68 
 
 		 564 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  37.04 
 
 		 341 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  43.64 
 
 		 420 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  42.86 
 
 		 582 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 420 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 420 aa  48.9  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0454  hypothetical protein  41.38 
 
 		 744 aa  48.9  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 420 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  40 
 
 		 321 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  41.18 
 
 		 358 aa  48.5  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 430 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  42.86 
 
 		 577 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  43.64 
 
 		 413 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 420 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  43.64 
 
 		 432 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.34 
 
 		 453 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 426 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  43.64 
 
 		 426 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  32.56 
 
 		 430 aa  48.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 536 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.5 
 
 		 406 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.39 
 
 		 432 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 575 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 556 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.57 
 
 		 1776 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.18 
 
 		 616 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  22.84 
 
 		 232 aa  46.2  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  35.29 
 
 		 466 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.51 
 
 		 907 aa  45.8  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  29 
 
 		 316 aa  45.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3346  SH3 type 3 domain protein  41.67 
 
 		 140 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 419 aa  45.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.73 
 
 		 471 aa  45.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 		 368 aa  44.3  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  23 
 
 		 379 aa  44.3  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>