61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2565 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  336  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  71.25 
 
 
170 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  45.4 
 
 
198 aa  141  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  45.35 
 
 
193 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  45.35 
 
 
193 aa  137  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  76.47 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  38.06 
 
 
589 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  36.88 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  35.46 
 
 
224 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  32.47 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  38.05 
 
 
214 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  31.34 
 
 
239 aa  67.8  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  35.51 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  34.44 
 
 
275 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  30.83 
 
 
259 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  39.24 
 
 
235 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  30.08 
 
 
220 aa  61.6  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  32.87 
 
 
281 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  44.44 
 
 
220 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  44.44 
 
 
221 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  44.44 
 
 
221 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  45.35 
 
 
225 aa  60.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  29.87 
 
 
289 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  31.34 
 
 
316 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  29.14 
 
 
283 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  32.61 
 
 
311 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  31.69 
 
 
312 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  31.69 
 
 
312 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  30.28 
 
 
301 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  32.71 
 
 
287 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  36.11 
 
 
264 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  31.19 
 
 
205 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  35.44 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  29.36 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  31.75 
 
 
564 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  31.75 
 
 
564 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_004310  BR0047  hypothetical protein  37.7 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  31.75 
 
 
564 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  31.75 
 
 
564 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  32.79 
 
 
564 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  34.25 
 
 
574 aa  42.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  50 
 
 
358 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.34 
 
 
474 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5056  SH3 type 3 domain protein  42.86 
 
 
94 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0895479  normal  0.96171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  33.33 
 
 
582 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
577 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
582 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4543  SH3 type 3 domain-containing protein  42.86 
 
 
94 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.146973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  34.12 
 
 
319 aa  41.2  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
580 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  33.33 
 
 
598 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5003  SH3 type 3 domain protein  42.86 
 
 
94 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
582 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  33.33 
 
 
579 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1863  SH3 type 3 domain-containing protein  40.35 
 
 
93 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.555002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  35.09 
 
 
341 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  30.68 
 
 
235 aa  40.8  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  31.08 
 
 
311 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  29.73 
 
 
310 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.61 
 
 
476 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  34.43 
 
 
578 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>