14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0047 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0047  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  65.56 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  35.5 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  35.5 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  32.8 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  32.97 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  32.93 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  35.8 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  32.93 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0715  hypothetical protein  33.71 
 
 		 269 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  44.7  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  39.71 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  30.95 
 
 		 589 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  34.33 
 
 		 214 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>